Дизайнер генов - Gene Designer

Дизайнер генов
Просмотр последовательности Gene Designer позволяет манипулировать элементами последовательности, выбором кодонов и положениями олигонуклеотидов. Быстрый поиск мотивов последовательностей, сайтов рестрикции и открытых рамок считывания.
Просмотр последовательностей Gene Designer позволяет манипулировать элементами последовательности, выбор кодонов, и олигонуклеотид позиции. Быстрый поиск последовательность мотивов, сайты ограничения, и открытые рамки для чтения.
Разработчики)ДНК2.0[1]
изначальный выпуск2006; 14 лет назад (2006)
Стабильный выпуск
2.01.191 / 9 октября 2015 г.; 5 лет назад (2015-10-09)
Операционная системаWindows, macOS, Linux
Платформаx86, x86-64
Доступно ванглийский
ТипМолекулярная биология Инструментарий
ЛицензияБесплатное ПО, требуется регистрация
Интернет сайтwww.dna20.com/Ресурсы/ genedesigner

Дизайнер генов это компьютер программного обеспечения пакет для биоинформатика.[2][3] Он используется молекулярные биологи от академических кругов, правительства, фармацевтической, химической, сельскохозяйственной и биотехнологической отраслей до дизайна,[4] клонировать и проверять генетические последовательности. это проприетарное программное обеспечение, выпущенный как бесплатное ПО требуется регистрация.

Функции

Gene Designer позволяет молекулярным биологам управлять всем процессом проектирования генов в одном приложении, используя ряд инструментов проектирования.

Клонирование Gene Designer с функцией перетаскивания. Пользователи могут перетаскивать вектор и вставляем в Cloning Tool; вырезать, комбинировать и клон. Gene Designer собирает клон которые затем можно добавить прямо в проект.

Воспитатель и ученик используют

Это бесплатное программное обеспечение было включено в учебные планы аудиторий и лабораторий по синтетической биологии, системной биологии, биоинженерии и биоинформатике. Студенты создают и завершают проекты, которые управляют всем процессом генного дизайна в одном приложении, используя ряд инструментов дизайна.

Примеры использования в учебных программах:

  • Курс синтетической биофотоники; Университет штата Юта, инженерный колледж[5]
  • Лабораторный проект с использованием Gene Designer 2.0[6]
  • Обзор урока системной биологии[7]
  • Обзор урока синтетической биологии[8]
  • Студенческие проекты[9]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ ДНК2.0
  2. ^ Вильялобос, Алан; Несс, Джон Э; Густафссон, Клаас; Миншалл, Джереми; Говиндараджан, Шридхар (2006). «Конструктор генов: инструмент синтетической биологии для создания искусственных сегментов ДНК». BMC Bioinformatics. 7: 285. Дои:10.1186/1471-2105-7-285. ЧВК  1523223. PMID  16756672.
  3. ^ Вильялобос, Алан; Уэлч, Марк; Миншалл, Джереми (2012). «Дизайн in Silico функциональных конструкций ДНК». В Peccoud, Жан (ред.). Синтез генов: методы и протоколы. Методы молекулярной биологии. 852. С. 197–213. Дои:10.1007/978-1-61779-564-0_15. ISBN  978-1-61779-563-3. PMID  22328435.
  4. ^ Уэлч, М; Виллалобос, А; Gustafsson, C; Миншалл, Дж (2011). «Разработка генов для успешной экспрессии белка». В Voigt, Кристофер (ред.). Синтетическая биология, часть B: Компьютерный дизайн и сборка ДНК. Методы в энзимологии. 498. С. 43–66. Дои:10.1016 / B978-0-12-385120-8.00003-6. ISBN  9780123851208. PMID  21601673.
  5. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010[мертвая ссылка ]
  6. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Systems_Biology_Laboratory[мертвая ссылка ]
  7. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Systems_Biology[мертвая ссылка ]
  8. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Synthetic_Biology[мертвая ссылка ]
  9. ^ http://www.engr.usu.edu/wiki/index.php/Synthetic_Biophotonics_2010_Student_Projects[мертвая ссылка ]

внешняя ссылка