Вирус гепатита B PRE 1151–1410 - Hepatitis B virus PRE 1151–1410

Вирус гепатита B PRE 1151–1410
RF02816.svg
Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности вируса гепатита B PRE 1151–1410
Идентификаторы
РфамRF02816
Прочие данные
Домен (ы)Вирусы
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO:,Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКSO: 0005836
PDB структурыPDBe

Вирус гепатита B PRE 1151–1410 (Посттранскрипционный регуляторный элемент HBV, нуклеотиды 1151–1410) является частью PRE HBV длиной 500 пар оснований, который, как предполагалось, является гепатит Б элемент экспорта РНК вируса (HBV).[1][2][3] Однако эта функция является спорным и новые регуляторные элементы, которые были предсказаны в PRE.[4] PRE 1151–1410 усиливает ядерный экспорт безинтронных транскриптов и репрессирует механизм сплайсинга до степени, сопоставимой с таковой у полноразмерного PRE. Поэтому было предложено быть основным элементом PRE HBV.[4] PRE1151–1410 содержит 3 известных регуляторных элемента: PRE SL-альфа (нуклеотиды 1292–1321),[5] сайт связывания человеческого белка La (нуклеотид 1275–1291),[6] SRE-1 (нуклеотиды 1252–1348).[7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Panjaworayan N, Roessner SK, Firth AE, Brown CM (декабрь 2007 г.). «HBVRegDB: аннотация, сравнение, обнаружение и визуализация регуляторных элементов в последовательностях вируса гепатита B». Журнал вирусологии. 4: 136. Дои:10.1186 / 1743-422X-4-136. ЧВК  2235840. PMID  18086305.
  2. ^ Хуан Дж., Лян Т. Дж. (Декабрь 1993 г.). «Новый генетический элемент вируса гепатита B (HBV) со свойствами, подобными элементу ответа Rev, который необходим для экспрессии продуктов гена HBV». Молекулярная и клеточная биология. 13 (12): 7476–7486. Дои:10.1128 / mcb.13.12.7476. ЧВК  364819. PMID  8246965.
  3. ^ Хуанг З.М., Йен Т.С. (май 1994 г.). «Элемент РНК вируса гепатита В, который способствует накоплению поверхностных транскриптов генов в цитоплазме». Журнал вирусологии. 68 (5): 3193–3199. Дои:10.1128 / JVI.68.5.3193-3199.1994. ЧВК  236810. PMID  8151782.
  4. ^ а б Visootsat A, Payungporn S, T-Thienprasert NP (декабрь 2015 г.). «Консервативный структурный элемент РНК в посттранскрипционном регуляторном элементе вируса гепатита В усиливает ядерный экспорт безинтронных транскриптов и подавляет механизм сплайсинга». Отчеты по молекулярной биологии. 42 (12): 1603–1614. Дои:10.1007 / s11033-015-3928-0. PMID  26514143.
  5. ^ Панджавораян Н., Пайунгпорн С., Поовораван Ю., Браун С.М. (сентябрь 2010 г.). «Идентификация эффективного сайта-мишени siRNA и функциональных регуляторных элементов в посттранскрипционном регуляторном элементе вируса гепатита B». Журнал вирусологии. 7: 216. Дои:10.1186 / 1743-422X-7-216. ЧВК  2945954. PMID  20822550.
  6. ^ Ehlers I, Horke S, Reumann K, Rang A, Grosse F, Will H, Heise T (октябрь 2004 г.). «Функциональная характеристика взаимодействия между человеческим La и РНК вируса гепатита В». Журнал биологической химии. 279 (42): 43437–43447. Дои:10.1074 / jbc.M402227200. PMID  15302879.
  7. ^ Heise T, Sommer G, Reumann K, Meyer I, Will H, Schaal H (2006). «PRE вируса гепатита В содержит регуляторный элемент сплайсинга». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (1): 353–363. Дои:10.1093 / нар / gkj440. ЧВК  1331995. PMID  16410615.