Национальный центр функциональной гликомики - Википедия - National Center for Functional Glycomics

Национальный центр функциональной гликомики (NCFG)

В Национальный центр функциональной гликомики это организация, которая сосредоточена на развитии технологий в гликонауках. Они специально сосредоточены на анализе гликанов и молекулярных механизмах распознавания гликанов белками, важными для биологии человека и болезней. Центр был основан в г. Университет Эмори в 2013 г. при финансировании в размере 5,5 млн долл. США Национальные институты здоровья[1][2][3] под руководством Ричард Д. Каммингс. Центр переехал в Гарвардский университет в сентябре 2015 года и в настоящее время находится по адресу Медицинский центр Бет Исраэль Диаконисса в Бостон Массачусетс.[4][5] Центр связан с Консорциум функциональной гликомики.

Национальный центр функциональной гликомики - один из четырех исследовательских центров биомедицинских технологий, связанных с гликомикой, в США.[6] Эти центры предоставляют уникальные технологии и методы в области исследования гликомики. Центр отвечает за услуги и обучение внешних следователей, а также за предоставление доступа и распространение технологий, методов и программного обеспечения.[7]

Исследовательские проекты

Проекты центра:[8]

  • Анализ потенциальных гликан-связывающих белков на различных массивах гликанов (массив гликанов CFG, массив микробных гликанов, массивы, полученные из NCFG)[требуется разъяснение ]
  • Структурный анализ гликанов
  • Производство встречающихся в природе гликанов путем выделения

Гликомика для дробовика

Центр исследует методы гликомики, при которых гликаны собирают и очищают из различных материалов, таких как грудное молоко и легкие свиньи. Такие методы, разработанные центром и другими гликомическими группами, могут быть дополнительно применены к тканям для создания общего гликома ткани для исследования различных заболеваний, таких как рак, воспаление и аутоиммунные заболевания.[9][10]

Окислительное высвобождение природных гликанов

В центре была разработана методика окислительного высвобождения природных гликанов. Этот процесс включает бытовую обработку тканей отбеливателем для высвобождения гликанов для гликомиков.[11] Конечная цель этого подхода - сделать гликомику доступной для более широкого сообщества ученых путем разработки легкодоступных инструментов.

GlycoPattern

Национальный центр функциональной гликомики разработал GlycoPattern, сетевой ресурс по биоинформатике для помощи в анализе данных массива гликанов. Веб-сайт GlycoPattern предлагает инструменты и алгоритмы для обнаружения структурных мотивов, визуализацию тепловой карты для множественных сравнений экспериментов, кластеризацию гликановых связывающих белков.[12][13]

Услуги

Национальный центр функциональной гликомики предлагает следующие услуги:

  • Печать нестандартных микрочипов на стеклянных слайдах
  • Анализ качественных и количественных изменений гликанов, связанных с заболеваниями и нарушениями, с помощью гликановой восстановительной изотопной маркировки и масс-спектрометрии.

внешняя ссылка

Рекомендации

  1. ^ NIH финансирует новый Национальный центр функциональной гликомики в Эмори
  2. ^ GenomeWeb News - Эмори выиграла 5,5 млн долларов на открытие Центра функциональной гликомики
  3. ^ DDNews- NIH профинансирует гликомический центр в Эмори
  4. ^ NIAID CEIRS - Известный гликобиолог и исследователь гриппа, доктор Ричард Каммингс, переходит в Гарвардскую медицинскую школу.
  5. ^ Разговор с Ричардом Каммингсом
  6. ^ Ресурсы NIH по исследованиям биомедицинских технологий для гликомики
  7. ^ Technology.org - Гликаны: зона наилучшего восприятия (18 октября 2016 г.)
  8. ^ Информация о проекте NIH: 5P41GM103694-05 Национальный центр функциональной гликомики
  9. ^ Ученый: как исправить сахар (1 апреля 2015 г.)
  10. ^ Сун, Сюэчжэн; Ласанаяк, Йи; Ся, Баоюнь; Хаймбург-Молинаро, Джейми; Рея, Жанна М; Джу, Хун; Чжао, Чуньмэй; Молинаро, Росс Дж; Каммингс, Ричард Д; Смит, Дэвид Ф (5 декабря 2010 г.). «Гликомика дробовика: стратегия микроматрицы для функциональной гликомики». Методы природы. 8 (1): 85–90. Дои:10.1038 / число 1540. ЧВК  3074519. PMID  21131969.
  11. ^ Сун, Сюэчжэн; Джу, Хун; Ласанаяк, Йи; Куделка, Мэтью Р.; Смит, Дэвид Ф; Каммингс, Ричард Д. (2 мая 2016 г.). «Окислительное высвобождение природных гликанов для функциональной гликомики». Методы природы. 13 (6): 528–534. Дои:10.1038 / nmeth.3861. ЧВК  4887297. PMID  27135973.
  12. ^ Agravat, S. B .; Saltz, J. H .; Каммингс, Р. Д .; Смит, Д. Ф. (20 августа 2014 г.). «GlycoPattern: веб-платформа для добычи массивов гликанов». Биоинформатика. 30 (23): 3417–3418. Дои:10.1093 / биоинформатика / btu559. ЧВК  4296152. PMID  25143288.
  13. ^ GlycoPattern