PTPN22 - Википедия - PTPN22

ПТПН22
Белок PTPN22 PDB 2p6x.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыПТПН22, протеинтирозинфосфатаза, нерецепторный тип 22 (лимфоидный), LYP, LYP1, LYP2, PEP, PTPN8, протеинтирозинфосфатаза, нерецепторный тип 22, PTPN22.6, PTPN22.5, протеинтирозинфосфатаза нерецепторного типа 22
Внешние идентификаторыOMIM: 600716 MGI: 107170 ГомолоГен: 7498 Генные карты: ПТПН22
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение PTPN22
Геномное расположение PTPN22
Группа1п13.2Начинать113,813,811 бп[1]
Конец113,871,753 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PTPN22 206060 s в формате fs.png

PBB GE PTPN22 208011 в формате fs.png

PBB GE PTPN22 208010 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001193431
NM_001308297
NM_012411
NM_015967

NM_008979

RefSeq (белок)

NP_001180360
NP_001295226
NP_036543
NP_057051

NP_033005

Расположение (UCSC)Chr 1: 113,81 - 113,87 МбChr 3: 103,86 - 103,91 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белковая тирозинфосфатаза нерецепторного типа 22 (лимфоидная), также известный как ПТПН22, это белок что у людей кодируется ПТПН22 ген.[5][6][7] Этот ген может выражаться в разных формы. PTPN22 влияет на чувствительность рецепторов Т- и В-клеток, а мутации связаны с увеличением или уменьшением риска аутоиммунных заболеваний.

Молекулярная биология

Ген расположен на коротком плече хромосомы 1 рядом с центромерой (1p13.2) крика (минус). прядь. Он имеет длину 57 898 оснований и кодирует белок из 807 аминокислот (молекулярная масса 91 705 Да). Всего 24 экзоны в гене и 21 варианте транскрипта, кодирующих 10 различных белков. Белки расположены в цитоплазма.[нужна цитата ]

Функция

Этот ген кодирует протеинтирозинфосфатаза что выражается в первую очередь в лимфоидные ткани. Этот фермент участвует в нескольких сигнальных путях, связанных с иммунным ответом. На основе моделей мышиной фосфатазы,[8][9] структурная идентификация,[10] и генетика человека[11] фосфатаза образует комплексы с C-src тирозинкиназа (Csk), связанный с контролем членов семейства Src. Мутация Arg620Trp нарушает связывание с Csk, изменяет чувствительность Т- и В-клеточных рецепторов и связана с аутоиммунными заболеваниями. Есть и другие предположения, что фосфатаза регулирует CBL функция в Т-клетка рецепторный сигнальный путь.[5] Возможны другие взаимодействия.

Ассоциация болезней

Обычный 1858T (rs2476601) Arg620Trp несинонимный однонуклеотидный полиморфизм расположен в ПТПН22 ген был связан с аутоиммунными заболеваниями, включая повышенный риск Диабет 1 типа, ревматоидный артрит, волчанка, Витилиго и Болезнь Грейвса, но пониженный риск болезнь Крона.[12][13][14]

Недавнее исследование предполагает, что мутация не снижает продолжительность жизни среди населения.[15] Мутация может сохраниться в процессе эволюции человека, поскольку она может обеспечивать гипериммунный ответ на инфекционное заболевание.[16]

Мутации в ПТПН22 чрезмерно представлены в рак молочной железы.[17]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134242 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027843 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б EntrezGene 26191
  6. ^ Мэтьюз Р.Дж., Боун Д.Б., Флорес Э., Томас М.Л. (май 1992 г.). «Характеристика гемопоэтических внутриклеточных протеинтирозинфосфатаз: описание фосфатазы, содержащей домен SH2, и другой, обогащенный последовательностями, богатыми пролином, глутаминовой кислотой, серином и треонином». Мол. Клетка. Биол. 12 (5): 2396–405. Дои:10.1128 / mcb.12.5.2396. ЧВК  364412. PMID  1373816.
  7. ^ Коэн С., Дади Х., Шауль Э., Шарф Н., Ройфман С.М. (март 1999 г.). «Клонирование и характеристика лимфоид-специфической, индуцибельной человеческой протеинтирозинфосфатазы, Lyp». Кровь. 93 (6): 2013–24. Дои:10.1182 / blood.V93.6.2013.406k25_2013_2024. PMID  10068674.
  8. ^ Cloutier JF, Veillette A (сентябрь 1996 г.). «Ассоциация ингибирующей тирозинкиназы p50csk с протеинтирозинфосфатазой PEP в Т-клетках и других гемопоэтических клетках». EMBO J. 15 (18): 4909–18. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00871.x. ЧВК  452228. PMID  8890164.
  9. ^ Грегорьев А., Клотье Дж. Ф., Вейлетт А. (май 1998 г.). «Требования к последовательности для ассоциации протеин-тирозинфосфатазы PEP с доменом 3 гомологии Src ингибирующей тирозиновой протеинкиназы p50 (csk)». J. Biol. Chem. 273 (21): 13217–22. Дои:10.1074 / jbc.273.21.13217. PMID  9582365.
  10. ^ Гхош Р., Шехтман А., Гогер М.Дж., Джи Х., Кауберн Д. (ноябрь 2001 г.). «Новое специфическое взаимодействие с участием домена Csk SH3 и его природного лиганда». Nat. Struct. Биол. 8 (11): 998–1004. Дои:10.1038 / nsb1101-998. PMID  11685249.
  11. ^ Ванг Т., Милетик А.В., Боттини Н., Мустелин Т. (сентябрь 2007 г.). «Белковая тирозинфосфатаза PTPN22 в аутоиммунитет человека». Аутоиммунитет. 40 (6): 453–61. Дои:10.1080/08916930701464897. PMID  17729039.
  12. ^ Ку Х., Тессье М.К., Хадсон Т.Дж., Полихронакос С. (март 2005 г.). «Подтверждение связи полиморфизма R620W в протеинтирозинфосфатазе PTPN22 с диабетом 1 типа в семейном исследовании». J. Med. Genet. 42 (3): 266–70. Дои:10.1136 / jmg.2004.026971. ЧВК  1736025. PMID  15744042.
  13. ^ Vang T, Congia M, Macis MD, Musumeci L, Orrú V, Zavattari P, Nika K, Tautz L, Taskén K, Cucca F, Mustelin T, Bottini N (декабрь 2005 г.). «Аутоиммунно-ассоциированная лимфоидная тирозинфосфатаза представляет собой вариант с усилением функции». Nat. Genet. 37 (12): 1317–9. Дои:10,1038 / ng1673. PMID  16273109.
  14. ^ Ghorban KH, Ezzeddini R, Eslami M, Yousefi B, Sadighi Moghaddam B, Tahoori MT, Dadmanesh M, Salek Farrokhi A (декабрь 2019 г.). «Полиморфизм C / T PTPN22 1858 связан с изменением профиля цитокинов как потенциальный патогенный механизм ревматоидного артрита». Письма иммунологии. 216: 106–113. Дои:10.1016 / j.imlet.2019.10.010. PMID  31669381.
  15. ^ Наполиони В., Натали А., Сакуччи П., Лукарини Н. (август 2011 г.). «Функциональный полиморфизм PTPN22 1858C> T (R620W) и продолжительность жизни человека». Мол. Биол. Представитель. 38 (6): 4231–5. Дои:10.1007 / s11033-010-0546-8. PMID  21113673.
  16. ^ «ПТПН22». NLM (правительство США). Получено 5 апреля 2013.
  17. ^ Кобольдт DC (2012). «Комплексные молекулярные портреты опухолей груди человека». Природа. Издательская группа "Природа". 490 (7418): 61–70. Дои:10.1038 / природа11412. ЧВК  3465532. PMID  23000897.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9Y2R2 (Тирозин-протеинфосфатаза нерецепторного типа 22) на PDBe-KB.