SPEN - Википедия - SPEN

SPEN
Белок SPEN PDB 1ow1.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSPEN, HIAA0929, MINT, RBM15C, SHARP, репрессор транскрипции семейства spen
Внешние идентификаторыOMIM: 613484 MGI: 1891706 ГомолоГен: 124461 Генные карты: SPEN
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение SPEN
Геномное расположение SPEN
Группа1п36.21-п36.13Начните15,836,095 бп[1]
Конец15,940,456 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SPEN 201997 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015001

NM_019763
NM_001347235

RefSeq (белок)

NP_055816

NP_001334164
NP_062737

Расположение (UCSC)Chr 1: 15.84 - 15.94 МбChr 4: 141,47 - 141,54 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Msx2-взаимодействующий белок это белок что у людей кодируется SPEN ген.[5][6][7]

Этот ген кодирует индуцируемый гормонами репрессор транскрипции. Подавление транскрипции этим генным продуктом может происходить за счет взаимодействия с другими репрессорами, за счет привлечения белков, участвующих в деацетилировании гистонов, или через секвестрацию активаторов транскрипции. Продукт этого гена содержит карбокси-концевой домен, который позволяет связываться с другими белками-корепрессорами. Этот домен также разрешает взаимодействие с членами комплекса NuRD, белкового комплекса, ремоделирующего нуклеосомы, который содержит деацетилазную активность. Кроме того, этот репрессор содержит несколько мотивов распознавания РНК, которые сообщают связывание с коактиватором РНК стероидного рецептора; это связывание может модулировать активность как лигандированных, так и нелигандированных стероидных рецепторов.[7]

Взаимодействия

SPEN был показан взаимодействовать с участием HDAC1,[6] SRA1[6] и Корепрессор ядерного рецептора 2.[6]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000065526 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040761 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Newberry EP, Latifi T, Towler DA (сентябрь 1999 г.). «RRM-домен MINT, нового связывающего Msx2 белка, распознает и регулирует промотор остеокальцина крысы». Биохимия. 38 (33): 10678–90. Дои:10.1021 / bi990967j. PMID  10451362.
  6. ^ а б c d Ши Ю., Доунс М., Се В., Као Х.Й., Ордентлич П., Цай С.К., Хон М., Эванс Р.М. (май 2001 г.). «Sharp, индуцибельный кофактор, который объединяет репрессию и активацию ядерных рецепторов». Genes Dev. 15 (9): 1140–51. Дои:10.1101 / gad.871201. ЧВК  312688. PMID  11331609.
  7. ^ а б «Ген Entrez: гомолог SPEN spen, регулятор транскрипции (Drosophila)».

дальнейшее чтение