TAF5L - TAF5L

TAF5L
Идентификаторы
ПсевдонимыTAF5L, PAF65B, фактор 5, связанный с ТАТА-бокс-связывающим белком, например
Внешние идентификаторыMGI: 1919039 ГомолоГен: 8676 Генные карты: TAF5L
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение TAF5L
Геномное расположение TAF5L
Группа1q42.13Начните229,593,111 бп[1]
Конец229,626,047 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TAF5L 213654 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001025247
NM_014409

NM_133966
NM_001357315

RefSeq (белок)

NP_001020418
NP_055224

NP_598727
NP_001344244

Расположение (UCSC)Chr 1: 229.59 - 229.63 МбChr 8: 124 - 124,02 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

TAF5-подобная РНК-полимераза II p300 / CBP-ассоциированный фактор 65 кДа субъединица 5L является фермент что у людей кодируется TAF5L ген.[5][6][7]

Функция

Продукт этого гена принадлежит к семейству белков TAF5 с WD-повторами. Этот ген кодирует белок, который является компонентом гистонацетилазного комплекса PCAF. Комплекс гистонацетилазы PCAF, состоящий из более чем 20 полипептидов, некоторые из которых являются TAF, необходим для миогенной транскрипции и дифференцировки. TAF могут участвовать в базовой транскрипции, служить коактиваторами, участвовать в распознавании промотора или изменять общие факторы транскрипции для облегчения сборки комплекса и инициации транскрипции. Кодируемый белок структурно подобен одному из гистоноподобных TAF, TAF5. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы, были идентифицированы для этого гена.[7]

Взаимодействия

TAF5L показал себя взаимодействовать с TAF9[8] и Гомолог белка инициации транскрипции SPT3.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135801 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038697 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Огрызко В.В., Котани Т., Чжан Х, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян XJ, Ховард Б.Х., Цинь Дж., Накатани Ю. (август 1998 г.). «Гистоноподобные TAF в гистонацетилазном комплексе PCAF». Клетка. 94 (1): 35–44. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81219-2. PMID  9674425.
  6. ^ Stanchi F, Bertocco E, Toppo S, Dioguardi R, Simionati B, Cannata N, Zimbello R, Lanfranchi G, Valle G (январь 2001 г.). «Характеристика 16 новых генов человека, показывающих высокое сходство с последовательностями дрожжей». Дрожжи. 18 (1): 69–80. Дои:10.1002 / 1097-0061 (200101) 18: 1 <69 :: AID-YEA647> 3.0.CO; 2-H. PMID  11124703.
  7. ^ а б «Ген Entrez: TAF5L TAF5-подобная РНК-полимераза II, фактор, связанный с p300 / CBP-ассоциированным фактором (PCAF), 65 кДа».
  8. ^ а б Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo». Мол. Клетка. Биол. 21 (20): 6782–95. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. ЧВК  99856. PMID  11564863.

дальнейшее чтение