HLA B7-DR15-DQ6 - HLA B7-DR15-DQ6

Мультигенный гаплотип, человек
HLA-mini.png
Область HLA на хромосоме 6
HLA A3-B7-DR15-DQ6
LociГенАллельСеротип
I класс
центромерный		HLA-C*0702Cw7
HLA-B*0702B7
HLA-DRHLA-DRB1*1501DR15
HLA-DRB5*0101DR51
HLA-DQHLA-DQA1*0102DQ1
HLA-DQB1*0602DQ6
Узлы
НаселениеМаксимаFreq.Максимум
Западный Ирландия6.0%
Размер и расположение
ГеныРасположениеразмер (кбит / с)
-66п21.32500

HLA B7-DR15-DQ6 является мультигенным гаплотип который охватывает большинство человеческих главный комплекс гистосовместимости на хромосома 6. Мультигенный гаплотип - это набор наследуемых аллели охватывающие несколько генов или генов-аллелей, общие мультигенные гаплотипы, как правило, являются результатом общего происхождения (имеют недавнего общего предка для этого сегмента хромосомы). Хромосомная рекомбинация фрагментирует мультигенные гаплотипы по мере того, как расстояние до этого предка увеличивается в количестве поколений.

HLA B7-DR15-DQ6 является представлением (по серотип ) общего HLA гаплотип найден в Западной Евразии. Гаплотип можно записать в расширенной форме, охватывающей основные локусы гистосовместимости, следующим образом:

HLA Cw*0702 : B*0702 : DRB1*1501 : DQA1*0102 : DQB1*0602

В более ранней литературе этот гаплотип описывается двумя разными способами. Один B7-DR2-DQ6 происходит из того факта, что DR15 является расщепленным антигеном серотипа широкого антигена DR2. Другой B7-DR2-DQ1 проистекает из того факта, что DQ1 является серотипом альфа-цепи, который теперь покрывается типами бета-цепей DQ5 и DQ6 (пары DQ1 с DQ5 и DQ6 путем спаривания цис-гаплотипов).

Есть два основных подгаплотипа, одному из которых предшествует его теломерный рядом с HLA A*0301 а другой - HLA A*0201. Гаплотип, несущий A * 0301 (HLA A3-B7-DR15-DQ6), описывается как самый длинный из известных мультигенных гаплотипов человека.

HLA A2-B7-DR15-DQ6

Добавление гаплотипа B7 :: DQ6 создает гаплотип A2-B7 :: DQ6. Этот гаплотип часто встречается в Северной Испании, Швейцарии, Нидерландах.

HLA A*0201Cw*0702 : B*0702 : DRB1*1501 : DQA1*0102 : DQB1*0602

HLA A3-B7-DR15-DQ6

Частоты гаплотипов HLA A3-B7
частотаРанг в
исх.Население(%)Поп.
[1]Швейцарский9.11
[2]Ирландия8.6
[3]Австрия7.41
[4]Северная Ирландия6.51
[5]Нидерланды6.6
[3]Бельгия6.01
[3]Шведский5.73
[6]Немецкий5.7
[3]Польский4.9
[3]румынский3.8
[3]Армения3.7
[3]португальский3.4
[3]Британский3.4
[3]Чешский3.1
[7]Сваны2.7
[3]Албания2.7
[8]Тосканская италия2.7
[3]испанский2.6
[3]Баскский2.5
[3]Италия1.6
[3]Греческий1.3
[9]Болгария1.1
1 Cw * 0702 (Европа)

Гено-аллельное представление гаплотипа:

HLA A*0301Cw*0702 : B*0702 : DRB1*1501 : DQA1*0102 : DQB1*0602

В настоящее время он считается самым длинным из широко распространенных предковых гаплотипов, его длина составляет 4,8 миллиона нуклеотидов и происходит от гена TRIM27. . . Гаплотип является узловым в Ирландии, но также часто встречается в Швейцарии, он имеет подузел в Пасиегосе на севере Испании. Существует некоторая разница в распределении A3 :: DQ6 по сравнению с A1 :: DQ2 в том смысле, что имеется больший уклон в сторону Центральной и Восточной Европы. Части гаплотипа распространяются в Восточную Азию и даже появляются в коренных популяциях Нового мира. DR15: пик частот DQ6 приходится на Центральную Азию, и есть подозрения, что это может быть точка евразийского распространения на запад в Европу.

Хотя с гаплотипом связаны некоторые заболевания, частота ассоциации меньше по сравнению с A1 :: B8.

Ассоциации болезней

Было обнаружено, что HLA B7-DR15-DQ6 связан с постменопаузой. остеопороз в Греческий Население.[10]

Было обнаружено, что DR2 (15 или 16) -DQ6.2 ассоциируется с (идиопатическим) нарколепсия -катаплексия [11] Гипокретин дефицит лиганда в головном мозге и спинномозговая жидкость также связано с нарколепсией-катаплексией. DR15-DQ6 также показывает связь с факторами (включая генетический фактор на хромосома 12p 12) вовлечены в семейные рассеянный склероз[12][13] DR15-DQ6 тесно связан с развитием неоваскулярных поражений хориоидеи в предполагаемых глазных гистоплазмоз синдром.[14]

Гаплотип DR15-DQ6 может обеспечить лучшую защиту от прогрессирования ВИЧ.[15] Однако гаплотип является фактором риска рак шейки матки.[16]

использованная литература

  1. ^ Grundschober C, Sanchez-Mazas A, Excoffier L, Langaney A, Jeannet M, Tiercy J (1994). «Полиморфизм ДНК HLA-DPB1 в швейцарской популяции: неравновесие по сцеплению с другими локусами HLA и популяционная генетическая аффинность». Eur J Immunogenet. 21 (3): 143–57. Дои:10.1111 / j.1744-313X.1994.tb00186.x. PMID  9098428.
  2. ^ Финч Т., Лоулор Э, Бортон М., Барнс С., Макнамара С., О'Риордан Дж., Макканн С., Дарк С. (1997). «Распространение генов и гаплотипов HLA-A, B и DR в ирландской популяции». Exp Clin Immunogenet. 14 (4): 250–63. PMID  9523161.
  3. ^ а б c d е ж г час я j k л м п Сасадзуки, Такехико; Цудзи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: материалы одиннадцатого Международного семинара и конференции по гистосовместимости, состоявшихся в Иокогаме, Япония, 6–13 ноября 1991 г.. Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN  0-19-262390-7.
  4. ^ Миддлтон Д., Уильямс Ф, Хэмилл М, Мина А. (2000). «Частота аллелей HLA-B в европеоидной популяции, определяемая двухэтапной стратегией типирования ПЦР-SSOP». Hum Immunol. 61 (12): 1285–97. Дои:10.1016 / S0198-8859 (00) 00186-5. PMID  11163085.
  5. ^ Шиппер Р., Шрейдер Дж., Д'Амаро Дж., Оудсхорн М. (1996). «Частота гена HLA и гаплотипов у голландских доноров крови». Тканевые антигены. 48 (5): 562–74. Дои:10.1111 / j.1399-0039.1996.tb02670.x. PMID  8988539.
  6. ^ <Мюллер C, Энингер G, Goldmann S (2003). «Частоты генов и гаплотипов для локусов hLA-A, hLA-B и hLA-DR на основе более чем 13 000 немецких доноров крови». Hum Immunol. 64 (1): 137–51. Дои:10.1016 / S0198-8859 (02) 00706-1. PMID  12507825.
  7. ^ Санчес-Веласко П., Лейва-Кобиан Ф. (2001). «Частоты аллелей HLA I и II классов изучались на уровне ДНК в популяции Сванетии (Верхний Кавказ) и их связь с популяциями Западной Европы». Тканевые антигены. 58 (4): 223–33. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2001.580402.x. PMID  11782273.
  8. ^ Маррони Ф., Курсио М., Форнасиари С., Лапи С., Мариотти М., Скатена Ф., Прециуттини С. (2004). «Микрогеографические вариации частот гаплотипов HLA-A, -B и -DR в Тоскане, Италия: значение для набора доноров костного мозга». Тканевые антигены. 64 (4): 478–85. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2004.00292.x. PMID  15361126.
  9. ^ Иванова М, Роземуллер Э, Тюфекчиев Н, Михайлова А, Тиланус М, Наумова Э (2002). «Полиморфизм HLA у болгар, определенный методами типирования с высоким разрешением, по сравнению с другими популяциями». Тканевые антигены. 60 (6): 496–504. Дои:10.1034 / j.1399-0039.2002.600605.x. PMID  12542743.
  10. ^ Douroudis K, Tarassi K, Athanassiades T и др. (Июнь 2007 г.). «Аллели HLA как факторы предрасположенности к постменопаузальному остеопорозу в греческой популяции». Тканевые антигены. 69 (6): 592–6. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2007.00833.x. PMID  17498269.
  11. ^ Нишино С., Канбаяши Т. (август 2005 г.). «Симптоматическая нарколепсия, катаплексия и гиперсомния, а также их последствия для гипоталамической системы гипокретин / орексин». Sleep Med Rev. 9 (4): 269–310. Дои:10.1016 / j.smrv.2005.03.004. PMID  16006155.
  12. ^ Стиклер М., Вальдес А.М., Гебель В. и др. (Январь 2004 г.). «Гаплотип HLA-DR2 связан с повышенным пролиферативным ответом на иммунодоминантный CD4 (+) Т-клеточный эпитоп в человеческом интерфероне-бета». Гены иммунной. 5 (1): 1–7. Дои:10.1038 / sj.gene.6364027. PMID  14735143.
  13. ^ Витале Э, Кук С., Сан Р. и др. (Февраль 2002 г.). «Анализ сцепления, обусловленный статусом HLA в крупной североамериканской родословной, подтверждает наличие локуса восприимчивости к рассеянному склерозу на хромосоме 12p12». Гм. Мол. Genet. 11 (3): 295–300. Дои:10,1093 / чмг / 11.3.295. PMID  11823448.
  14. ^ Дабил Х., Каплан Х.Д., Даффи Б.Ф., Фелан Д.Л., Моханакумар Т., Джарамилло А. (октябрь 2003 г.). «Связь гаплотипа HLA-DR15 / HLA-DQ6 с развитием хориоидальных неоваскулярных поражений при предполагаемом синдроме глазного гистоплазмоза». Гм. Иммунол. 64 (10): 960–4. Дои:10.1016 / S0198-8859 (03) 00175-7. PMID  14522093.
  15. ^ Вякарнам А., Сайдботтом Д., Мурад С. и др. (Май 2004 г.). «Обладание аллелями человеческого лейкоцитарного антигена DQ6 и скорость снижения уровня CD4 Т-лимфоцитов при инфицировании вирусом иммунодефицита человека-1». Иммунология. 112 (1): 136–42. Дои:10.1111 / j.1365-2567.2004.01848.x. ЧВК  1782463. PMID  15096192.
  16. ^ Гадери М., Валлин К.Л., Виклунд Ф. и др. (Август 2002 г.). «Риск инвазивного рака шейки матки, связанный с полиморфными гаплотипами HLA DR / DQ». Int. J. Рак. 100 (6): 698–701. Дои:10.1002 / ijc.10551. PMID  12209609.